La Scuola di Specializzazione in Microbiologia e Virologia si propone di formare specialisti che dovranno maturare approfondite conoscenze delle basi biochimiche e molecolari delle funzioni biologiche dei microrganismi nel campo della batteriologia, virologia, micologia e parassitologia medica nonchè sulle interazioni  microrganismo-ospite, rappresentando tali interazioni modelli semplici per lo studio e la comprensione di processi biologici fondamentali; acquisire la capacità professionale per valutare gli aspetti diagnostico-clinici delle analisi batteriologiche, virologiche, micologiche e parassitologiche applicate alla patologia umana mediante l'apprendimento di metodologie sia dirette, colturali e molecolari, che indirette tramite analisi della risposta immunitaria dell'ospite nei confronti dell'agente infettivo e delle procedure strumentali, incluse quelle automatizzate; comprendere le basi molecolari e cellulari della resistenza ai farmaci ed i criteri per la sorveglianza delle resistenze antibiotiche, soprattutto in ambito ospedaliero; acquisire  competenze riguardanti l'organizzazione e la legislazione relativa alla gestione del Laboratorio di Microbiologia e Virologia, con particolare riferimento alla gestione del "sistema qualità", alla sicurezza in laboratorio e allo smaltimento di rifiuti tossici o contagiosi; raggiungere la maturità professionale per partecipare alla programmazione, sperimentazione ed interpretazione dei risultati di studi clinici.